Phần mềm hình ảnh NIS-Elements của Nikon cho thị trường kính hiển vi  kết hợp thông minh tự động hóa từ kính hiển vi, camera, các phụ kiện và các thiết bị ngoại biên với năng lực mạnh cho lưu trữ, phân tích, dụng cụ quan sát và lưu trữ. Giao diện trực giác đơn giản hóa quy trình công việc và tạo ra khả năng thu nhận nhanh khi  cung cấp tính năng mạnh mẽ như khâu nối hình ảnh , đếm vật tự động và quan sát hình khối., dải động học cao, mở rộng chiều sâu tiêu cự và tỷ lệ và phân tích FRET

NIS- Elements Advanced Research: tối ưu cho nghiên cứu cao cấp. Đặc trưng là điều khiển thiết bị tự động thông qua chụp và phân tích hình ảnh 6D.

NIS- Elements Basic Research: được phát triển cho những ứng dụng nghiên cứu tiêu chuẩn như phân tích và dữ liệu ảnh huỳnh quang, NIS-Elements BR thu ảnh tới 4 chiều 9$-D) và năng lực điều khiển thiết bị tiên tiến.

NIS- Elements Documentation: hỗ trợ mầu tài liệu yêu cầu trong ứng dụng sinh học, lâm sàng và công nghiệp với tính năng đo đạc cơ bản và báo cáo.

NIS- Elements Confocal: có khả năng kết hợp đầy đủ sự điều khiển chuyên biệt confocal với chức năng phân tích hình ảnh tiên tiến.

NIS- Elements HC: hỗ trợ hoạt động tổng thể sự phân tích nội dung cao, từ kết hợp điều khiển kính hiển vi và các thiết bị ngoại vi như tấm đĩa giếng màu và CCD camera, tới quản lý dữ liệu hình ảnh.